El campus principal de la UPNFM esta ubicado en el sureste de Tegucigalpa, capital de Honduras, y se encuentra rodeado de boulevares.Tambien forma parte del campus universitario el Centro de Investigación e Innovación Educativa (CIIE).


El Centro Universitario Regional de San Pedro Sula, funciona en la ciudad de San Pedro Sula. Dicho centro tiene únicamente la modalidad de presencial y se ofrecen las siguientes carreras: